成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。

　　「Starlight」——那是远方星球的、过去往昔的、遥远未来的故事。　　在这部戏剧中，沐浴在舞台闪光中的两位少女，交换了命运。　　「两人一起成为Star」「在舞台上等着你」　　烧尽普通的快乐与喜悦，为了实现命运。　　仅仅5岁，就将命运投入熔炉。　　——实在是很危险呢。　　两人终于重逢。　　一人